Wissenschaftlicher Mitarbeiter (m/w/d) für eine Promotionsarbeit im Schnittstellenbereich Bioinformatik und translationale Onkologie
Universitätsmedizin Göttingen
Göttingen, DE
vor 3 Tg.
  • Befristung : zunächst befristet auf zwei Jahre
  • Arbeitszeit : Teilzeit (25,025h / Woche)
  • Entgelt : Entgelt nach TV-L
  • Anzeige veröffentlicht am 07.07.2020
  • Stelle zu besetzen ab 07.07.2020
  • Bewerbungsschluss : 17.08.2020
  • Als Teil des Comprehensive Cancer Center (CCC) wird zurzeit an der Universitätsmedizin Göttingen (UMG) ein Molekulares Tumor Board (MTB) eingerichtet, in dem mit auf patientenspezifischen Biomarker eine zielgerichtete Tumortherapie identifiziert werden soll.

    Dazu werden Methoden, Software und Wissensdatenbanken zur Bewertung genetischer Veränderungen in Tumoren und zur Vorhersage und Bewertung von personalisierten Behandlungsmöglichkeiten benötigt.

    Es werden bioinformatische Werkzeuge, lokale Wissensdatenbanken und Ontologien entwickelt, um im Zusammenspiel mit Weltwissen und existierenden Tools patientenspezifische Therapieoptionen für die Onkologen aufzubereiten.

    Ein wichtiger Schwerpunkt in dem Projekt ist die Analyse und Modellierung des Wissens und der Informationen aus dem Klinikum diese Daten zu speichern und den Tools verfügbar zu machen.

    Hierfür ist das Team interdisziplinär aufgebaut und umfasst an der Universitätsmedizin Göttingen das Institut für Medizinische Bioinformatik, die Klinik für Onkologie und das Institut für Medizininformatik.

    Zusätzliche Kooperationspartner sind das Institut für Pathologie der UMG sowie das Westdeutsche Tumorzentrum in Münster und das Deutsche Krebsforschungszentrum.

    Ihre Aufgaben :

  • Unterstützung des Projekts an der Schnittstelle zwischen Tumorgenetik, Bioinformatik und praktischer Anwendung in der klinischen Onkologie
  • Identifizierung und Modellierung wichtiger Daten aus der Klinik
  • Vereinheitlichung und Interpretation von Daten für die Annotation mit selbst entwickelten Ontologien
  • Aufarbeitung von Daten aus dem Molekularen Tumor Board und den Befunden der Patienten zur Schaffung eines lokalen Repositoriums
  • Mitarbeit bei der Entwicklung von Methoden zur Unterstützung der Vorbereitung des molekularen Tumorboards
  • Aufbau eines Wissensrepositoriums zur Speicherung des Wissens von lokalen Experten und Ergebnissen des molekularen Tumorboards
  • Ihr Profil :

  • abgeschlossenes Hochschulstudium in molekularer Medizin, Bioinformatik, Biologie, Humanmedizin, oder einem vergleichbaren Studiengang
  • Interesse an dem Lösen von biomedizinischen Fragestellungen mit bioinformatischen Methoden, möglichst bereits Programmiererfahrung in z.B. Python, R oder Java
  • Interesse am Analysieren und Erfragen von Informationen und deren Modellierung
  • Grundverständnis über Tumorerkrankungen und Tumorgenetik
  • idealerweise Erfahrungen aus wissenschaftlichen Projekten oder Initiativen
  • Interesse an interdisziplinären Arbeiten und Neugier auf Herausforderungen außerhalb Ihres ursprünglichen Fachgebiets
  • einen Blick für das Ganze und Interesse an der Entwicklung eines nachhaltigen Ergebnisses
  • Englisch und Deutsch flüssig in Wort und Schrift
  • Unser Angebot :

  • interdisziplinäres Promotionsprojekt an der Schnittstelle zwischen translationaler Onkologie und Bioinformatik, befristet innerhalb des Förderzeitraumes des Projektes
  • eine strukturierte, begleitete Einarbeitung
  • vielseitiger Arbeitsplatz in einem multiprofessionellen, interdisziplinären Team
  • Gesundheit und Sport gefördert durch ein ausgezeichnetes betriebliches Gesundheitsmanagement
  • vielfältige interessante Benefits (u.a. betriebseigene Kindertagesstätte, Kinderferienbetreuung, attraktive Infrastruktur, Jobtickets)
  • Vergütung nach TV-L mit verschiedenen Sozialleistungen, z. B. eine betriebliche Altersversorgung
  • Bei Rückfragen geben Ihnen Dr. Raphael Koch und Dr. Jürgen Dönitz (office bioinf.med.uni-goettingen) Auskunft.

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